楊祖馨1938年自臺北帝國大學理農學部農藝化學科畢業，在濱口榮次郎的指導下書寫研究論文，題目為臺灣產廢糖蜜の膠狀性質に就て，並以〈臺灣產廢糖蜜二三の性質〉一文公開發表。

      耕地白糖製造技術為製糖技術改良研究的核心，在蔗汁製成蔗糖過程中加以漂白，直接製成白糖，即所謂耕地白糖，可節省龐大的人力與燃料，至1930年代，製糖業者生產耕地白糖的意願提高，因而委託臺北帝國大學製糖化學研究室的濱口榮次郎教授，主持耕地白糖之技術研究，楊祖馨參與其中並與濱口榮次郎教授共同發表論文。

      研究不僅限於實驗室，也走出實驗室到工廠的生產現場實際操作，找出可行之製程，對於生產現場的製程相當重視。戰後，楊祖馨持續在臺大任教，主持營養研究室，並曾協助大同研究味精製造。